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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

不停看做化工行业奶茶原料而被掌握的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“分泌垃圾”作为“藏宝之小氧分子”的苦不堪言路程差不多,有一天近二十多年才被看到其很重要的海洋生理学功效,终是“坐起农奴把演唱”,越来越是在免疫性真菌感染性常见消化道疾病学习方面内熠熠生辉。多余篇文章新闻稿件了在各种各样的真菌感染性常见消化道疾病的甲壳动物模式中享受衣康酸或其生物装饰衍海洋生物的缓解益处,并看到其风险靶点。对衣康酸的“上辈子”与“今世”,详情文案《乳酸的逆袭吧哥们儿——衣康酸!选文让你认知衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸体现蛋白质组学产品,实现1000+艰深度装饰位点查出,安稳再现精典靶点,全方面生信介绍解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“得知”到“印证”全步骤服务培训,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、实验室程序流程

02、测试大数据大数据

03、经“点”重演

在实际数据分析中,查出多条论文资料中新闻报导的经点靶点基本衣康酸突显位点,如同一个被察觉到的衣康酸共价突显蛋清KEAP1,另外还有糖酵解信号通路中的3个至关重要酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,相应炎性小体组建蛋清NLRP3和细胞核细胞坏死整个过程中的至关重要蛋清RIPK3等,其质谱图详细图一样。

04、食品优点

1.多大质控

企业化特情人探头孵育、SDS-PAGE验测、WB检验、样例重要性性具体分析等各种位验测,为了保证項目毕竟信得过性。

2.高特性质谱仪器设备网络平台

在Orbitrap Astral全新几代高识别质谱仪带动下,保证 衣康过酸呈现位点及蛋白质司法鉴定新高度,推助数学深入分析探索与发现了。

3.全工艺流程一走式产品

由于拜谱生物工程落实的工拜谱生物台,可给予“上皮细胞训练→测试探针孵育→WB测试→深奥度衣康碱化突显测试→專屬生信讲解→目标位点PRM查验”全环节服务保障,省时保持平衡更又省心。

05、概述项目(部位)

06、应用角度

PART 2、论文资料分亨

论文一

日文主题词:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

2英文标题文字:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

探索相关内容:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

论文二

国外英文大标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

中文字幕主题词:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

研究探讨网站内容:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、案例库产生难点

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13含有强些的底物融入能力素质,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱怪物衣康硝化作用绘制组监测统计资料中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康碱化淡化(下面的图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱总结

对于TCA循环系统中的前面新陈分解物,衣康酸调高新陈分解、抗体系统和慢性炎症病变期间的双方角色,为的诊治抗体系统慢性炎症病变性重大重大疾病打造数据了重复使用的诊治机制。衣康酸架构中的亲电性α,β-不达到饱和状态羧酸架构能对蛋清酶质上的灵活性半胱氨酸残基使用烷基化淡化(迈克尔加持响应),这些翻譯后淡化被是指“衣康酸淡化(itaconation)”,随之引响蛋清酶质性能,宏观调控抗体系统回话和新陈分解条件,为好几种重大重大疾病药品研发部打造数据新工作思路。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸掩盖血清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物临床可以说按量靶向疗法代谢转化组(QMT1000)或动能产生靶向药物产生组货品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

借鉴资料

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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