毒理学是设计物理防御物理、物理防御和微生物溶液剂对微动小球的造成损害的功效的专业学位。管控毒理学考试对开放卫生的中药饮片、农用机械物理防御物理品和顾客好产品，还有判定和管理制度情况爆出对营养的暗藏导致是有必要的。毒素DNA组学測量休内和身体外的大分子波动，以熟知和预估毒素对营养的不良影响到导致。据预估，毒素DNA组学将经过体现更早、更更准的毒理学预估和从生物绘图到人類的外推，于是改进损害辨认和安全隐患评估报告格式，还有齐全改进毒理学。 2023年-9月2日，菲律宾渥太华院校怪物系Carole L. Yauk 微商团队在Nature Reviews Genetics（IF=39.1）上网上发稿了一篇“Progress in toxicogenomics to protect human health”，文章标题表示前段日子转录组学机构的高通骁龙量性因此在一下试验中还可以风险评估二个含水量、日子点和化学物质。最后，其它的工作染色体组技木，如蛋白酶质组学、分解代谢组学和表观染色体组学，越发越大规模并入毒副作用染色体组学的研究，为毒副作用缘由出具了摄入电子证据（图1）。

毒素引导的转录组谱被也可能设别含有的条件、与毒副目的和含水量反映关联的的模式，以预测分析目的逻辑和隐患。回收利用毒素冲磁学实体沙盘模型，从转录本的含水量-反映或密度-反映实体沙盘模型计算出来的起点网外移动到关联的人身体含水量，为了与“事实日常生活”的人身体曝光进行相对较。根据转录组学和多种组学动态字段的动态信息也可能整合资源以增加其团体边际效用（图1）。

图1. 实现毒素表观遗传组学庇护猿类绿色健康（图源：Meier et al., Nat Rev Genet, 2024）

01、知道共识机制和预測风险

手段和电脑网络研究分析是成立超大转录组数据显示统计显示集和认定毒理学制度化和隐性键康直接影响的厉害器具。只不过，转录组不同(能够是适应能力性的，也能够是非常不利的)与不错的察到的毒副反应导致彼此的繁杂关系的给解答造成 了成就。为了能让克制一些影响，显示了预侧毒理学，之中基本传统模式匹配好措施采用于新的(特地成立的)和原有的数据显示统计显示库，以开发技术转录组微生物标准牌物，一些标准牌物应有主矛盾的特殊性、效应和可反复相对标准偏差，将碳原子不同与毒理学反应基本传统模式和干扰连续下去(图2)，相当有益于处理好金融业和室内环境中或缺新一轮毒理学数据显示统计显示的上千人种东西，并突显出了非小动物实验室检测机系统的日趋采用。 图2拜谱生物展示出的是经由摸式，适配、转录组微菌物工程制品体标示物和权重什么是染色体共描述爱剖析預測分析渗透性的产品工艺流程。第一方面将昆虫或肿瘤神经细胞曝光于不引发的需求电化工品目渗透性报告单(但已经有微菌物工程制品体亲水性)的这个原形化工品和电化工品中，创立转录组谱基准资料数剧库（图2a）。经由摸式，适配，可拜谱生物展示出每这个原形化工品中最上涨和变动什么是染色体的相连性图谱转录变换无常的定级程序(图2b)。将仪器学校采用于基准资料数剧，以分离出預測分析抽象办法型渗透性几率比的转录组微菌物工程制品体标示物，这种转录组微菌物工程制品体标示物包涵一题材表面出描述爱变换无常的什么是染色体，可以用于預測分析能力和伤害的毒理学制度化（图2c）。前者，权重什么是染色体共描述爱网格（WGCNA）从魔幻数剧汇集分辨出可以用于預測分析电化工介导病理学和渗透性制度化的共干预什么是染色体簇。相对 每个人种办法，需要实施新的证实调查，采用肿瘤神经细胞或昆虫统计汇总测评来明确新无机化合物能不能需要是介导了与基准资料化工品的连接方式图谱相适配的转录谱，能不能需要是与转录组微菌物工程制品体标示物(預測分析特殊制度化)关于，相应能不能需要是靶向药物預測分析簇内什么是染色体的描述爱变换无常。

图2. 能够策略配备、转录组海洋生物圆形标志物和加权平均基因组共表答解析予测致癌性

（图源：Meier et al., Nat Rev Genet, 2024）

02、单人体细胞和前景的毒素基因组组学

大都数有害物质DNA组学理论论述校正了巨大企业机构或模本的转录谱，这影响了它们之间评定特定的上皮内部群提出的的信号灯的程度。在例如全部整个企业机构模本的大多数上皮内部型提出的不起作用的信号灯的异质性中，珍贵和未定量分析的上皮内部归类对有害物质的转录不起作用更是不可校正。于是，单上皮内部RNA测序(scRNA-seq)和环境空间转录组学还有机会极大程度上切实加强策略毒理学理论论述。 与非常多团体机构中的RNA-seq相对，scRNA-seq自动侧量每个数学分离出来癌神经团体中的人类DNA表述，这相对于自动侧量癌神经团体对毒素的炎症因子朋友想法至关关键。举例说明，在肺样本量量中，碱式盐粒癌神经团体转录组应该在癌神经团体非常成熟和沾染想法一阶段情况了变动，但各种表现能够会被非常多RNA-seq所改废，这种RNA-seq搅拌了所有都具有特别各不相同转录组的癌神经团体的形式，如上皮癌神经团体(图3a)。在普通机械有机物的裸漏下，团体机构样本量量体现 人类DNA的转录的水平情况了变动（图3b），但便用非常多RNA-seq自动侧量的人类DNA1、人类DNA2和人类DNA3的人类DNA表述变动基本是沉默不语的。不同，单癌神经团体RNA-seq以高些的准确度度捕捉到癌神经团体的形式炎症因子朋友人类DNA表述变动（图3c-d）。 其实在毒理学运用中还较为级新生，但scRNA-seq和办公空间转录组学就已经 始于能提供有意义的观点。

图3. 毒理学单受损细胞RNA测序

（图源：Meier et al., Nat Rev Genet, 2024）

03、单癌细胞和空间区域的化学品基因遗传组学

转录组学近年是毒素遗传遗传基因遗传组学的本质，但软件机系统毒理学可能在预估和资源优化配置根据二个菌物团体程度的讯息，为毒素的反应可能提供上限的独到见解。软件机系统毒理学要有“两组学”，进来转录组学可能与遗传遗传基因遗传组学、表观遗传遗传基因遗传组学、蛋清质组学、分解组学、脂质组学和三维成像表型组学相根据，以彻底解决分析的方式与人体细胞和团体表型各种相关的原子核优缺点。总的来讲，这部分的方式已被诸多适用理论研究探讨药剂学学效用、皮肤疾病病征学和正常值菌物程序的重塑。在毒理学的底色下，两组学早就被适用诊疗APP和理论研究探讨氛围暴晒的反应(图4)。

图4. 多个学在系统软件毒理学中的能力

（图源：Meier et al., Nat Rev Genet, 2024）

拜谱个人心得体会

两组学论述和资料梳理方式大量APP广泛于临床治疗实验毒理学，论述抗癫痫药物和急病工作状态的微生物反馈。两组学能能增进“个性文字化毒理学”的完成，当中ibms的资料源使用以預测临床治疗实验最终。不仅，坏境裸漏APP广泛的操作系统毒理学两组学越变越部分地区使用以论述坏境化学物质品对人间祖先绿色的作用，这就在增加我们大家对人间祖先裸漏(即对我的累积到坏境裸漏和关于作用)的联系。 系統性软件毒理学由各个层级的动物组织性组合成，从上皮内部反响到动物品关卡反响。产自这类各个方式动物原子核（如DNA、营养材料质、基础消化吸收物、脂质等）的数据源具备了观于耐腐蚀上材料或任何应激状态源对动物系統性软件扰动的补充营养的信息查询。DNA组、转录组、单上皮内部转录组、营养材料组、基础消化吸收组、脂质组等系統性软件动物学的措施能接受让我们对很多层级的原子核做定性分析，之后預测耐腐蚀上品有害，并成人体绿色健康分险评定具备的信息查询。

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参照医学文献：Meier MJ, Harrill J, Johnson K, Thomas RS, Tong W, Rager JE, Yauk CL. Progress in toxicogenomics to protect human health. Nat Rev Genet. 2024 Sep 2. doi: 10.1038/s41576-024-00767-1.